Esta indicada en el tratamiento de las fisuras anales crónicas, debido a su propiedad de relajar el esfínter anal, para aliviar el dolor y ayudar en la curación de estas fisuras. Tratamiento tópico para pacientes con enfermedad de Raynaud resistente o con respuesta baja a tratamientos iniciales (calcio antagonistas, prostaglandinas IV) y que no sean tolerantes o que no respondan a tratamiento con inhibidores de fosfodiesterasa. Recientemente se ha descrito la utilidad de la nitroglicerina en tópica al 2% en el tratamiento de la condrodermatitis nodular helix (CNH) con buenos resultados.
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